Java bindings - Adding Atomic* support

AtomicIntegers are used to address some concurrency problems in Java, and this
is advised by some metrics libraries like Netflix's servo:

https://github.com/Netflix/servo/wiki#jmx

Unfortunately, the GenericJMXConfValue.java class is not able to get the values
from such types, hence this PR.

I scanned the Java doc for the Java package:
https://docs.oracle.com/javase/8/docs/api/java/util/concurrent/atomic/package-summary.html
I think I have not forgotten any types.

Tests: tested at runtime

Merge pull request #2140 from maryamtahhan/feat_ras_bugfix

mcelog: Bug fixes and code style changes

mcelog: Address PR comments.

Change-Id: Ifde0311b54535b8cd5b3e0ccb05ce908dc499f62
Signed-off-by: Przemyslaw Szczerbik <przemyslawx.szczerbik@intel.com>

mcelog: Minor changes

Change-Id: I99f8ed0b30c9f8bc6d7b22deb291e30ca0301507
Signed-off-by: Przemyslaw Szczerbik <przemyslawx.szczerbik@intel.com>

mcelog: Free notification metadata

Change-Id: I68f883415a1c5d75cecb748b6c5788b536903333
Signed-off-by: Przemyslaw Szczerbik <przemyslawx.szczerbik@intel.com>

mcelog: Dispatch notification on successful connection to mcelog server

Change-Id: Ia5503972c665a2e951a2c5f14847be4c7580a9f3
Signed-off-by: Przemyslaw Szczerbik <przemyslawx.szczerbik@intel.com>

mcelog: Check if location was correctly parsed

Avoid dispatching metrics if location (used as plugin instance) wasn't parsed
correctly. Such thing can occur when there are no machine check exceptions
reported by mcelog server. With csv plugin enabled, it was causing a creation of
unexpected mcelog directory with all files (metrics) filled out with 0's.

Change-Id: Ib01f355a986ee5c6191cd126e1b32ef956ffce1f
Signed-off-by: Przemyslaw Szczerbik <przemyslawx.szczerbik@intel.com>

mcelog: Increase delay between socket reinitialization

Change delay between subsequent socket reinitialization attempts from 1000 usec
to 1000 ms. Such frequent attempts were affecting collectd functionality and
flooded the syslog. Issue can be eaisly reproduced by stopping mcelog service
while collectd with mcelog plugin enabled is running.

Signed-off-by: Przemyslaw Szczerbik <przemyslawx.szczerbik@intel.com>

Merge pull request #2141 from piotr1212/link_unixsock_with_cmds

unixsock.so: undefined symbol: handle_getthreshold -> link unixsock against libcmds

link unixsock against libcmds

unixsock_la_LIBS is not being processed by automake and thus being
incorrectly linked. This results in an symbol error when loading
the module. Changing to unixsock_la_LIBADD fixes this.

Merge branch 'collectd-5.7'

Merge branch 'collectd-5.6' into collectd-5.7

chrony: add missing build flag

This is a backport of 211bd4843.

collectd.spec: ensure write_riemann build deps are installed

collectd.spec: fixes to previous commit

collectd.spec: re-enable write_riemann on EL7, as build dep is now available in EPEL7

Merge branch 'collectd-5.6' into collectd-5.7

chrony: add missing build flag

The chrony plugin uses the `pow()` math function so it needs to be built with `-lm`. Otherwise collectd crashes with `symbol lookup error: /usr/lib/collectd/chrony.so: undefined symbol: pow`.

curl_json: use configured interval as default timeout value

When no timeout is specified, the default timeout should be set to the
configured interval, not the default timeout (which is -1, no timeout).

This bug got introduced in bce14a848.

Merge pull request #2130 from maryamtahhan/issue_ovs_events_2127

ovs_events: fix #2127

ovs_events: fix #2127

- Fixed FreeBSD compilation issue
- Fixed CLANG warnings:
   "-Wsign-compare, -Wtautological-compare"

Change-Id: I7a58271c34120e2782e43d4245abefebae2601ca
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

Merge pull request #2095 from maryamtahhan/dpdkstat_utils_rework

dpdkstat plugin rework

Addressing PR comments related with dpdk_utils

Change-Id: I4d6e132e0b5aa940a9c444c141967c8b79d90f0e
Signed-off-by: Krzysztof Matczak <krzysztofx.matczak@intel.com>

PR review comments addressed

Adressed comments raised during PR review. Removed documentation
chapter related with static linking since it was outdated and
there's no single universal solution for all supported DPDK
releases. Static linking of external libraries into plugins
is not supported in collectd.

Change-Id: I35f7decb0fdacaaaad50fa2bf35f7ba6aa96c3f0
Signed-off-by: Krzysztof Matczak <krzysztofx.matczak@intel.com>

dpdkstat plugin rework

This patch contains rework of existing dpdkstat plugin. Changes are focused on
extracting common dpdk related features into utils file that could be reused by
other DPDK plugins. Also some related structural changes are introduced.

List of changes:
- introduction of new utils_dpdk.c that handles child process spawning,
  and terminating, messaging between parent and child, DPDK configuration
  and initialization and DPDK commands execution
- DPDK EAL specific options put into separate subsection of
  dpdkstat configuration
- documentation update

Those changes are preparatory steps for upstreaming dpdkevent plugin
that is going to collect DPDK ports and logical cores status info.

Signed-off-by: Krzysztof Matczak <krzysztofx.matczak@intel.com>

ovs_events: fix build failures on Jessie

src/utils_ovs.c: In function ‘ovs_db_table_update_cb’:
src/utils_ovs.c:464:15: error: unused variable ‘table_name’ [-Werror=unused-variable]
   const char *table_name = NULL;
               ^~~~~~~~~~
src/utils_ovs.c:463:10: error: unused variable ‘obj_len’ [-Werror=unused-variable]
   size_t obj_len = 0;
          ^~~~~~~
src/utils_ovs.c:462:12: error: unused variable ‘jtable_update’ [-Werror=unused-variable]
   yajl_val jtable_update;
            ^~~~~~~~~~~~~
src/utils_ovs.c: In function ‘ovs_db_reconnect’:
src/utils_ovs.c:713:22: error: unused variable ‘saunix’ [-Werror=unused-variable]
   struct sockaddr_un saunix;
                      ^~~~~~
src/utils_ovs.c:710:14: error: unused variable ‘unix_prefix’ [-Werror=unused-variable]
   const char unix_prefix[] = "unix:";
              ^~~~~~~~~~~
src/utils_ovs.c: In function ‘ovs_yajl_gen_val’:
src/utils_ovs.c:373:10: error: ‘yajl_gen_ret’ may be used uninitialized in this function [-Werror=maybe-uninitialized]
   return yajl_gen_ret;
          ^~~~~~~~~~~~
cc1: all warnings being treated as errors

Makefile.am: keep plugins sorted

ovs_events plugin: fix build

collectd.spec: add new ovs_events plugin

Makefile.am: fix indentation

Merge pull request #2097 from YmrDtnJu/zfs_arc

zfs_arc updates for linux

Makefile.am: sort some stuff

ceph plugin: remove unused assignment

ovs_events: append flags to _CPPFLAGS, not _CFLAGS

zfs_arc: Do not log an error if a value cannot be found.

configure.ac: keep plugins sorted

collectd.spec: add new mcelog plugin

Merge pull request #1971 from maryamtahhan/feat_ovs_link

OVS events plugin

intel_rdt: check libpqos library version.

Change-Id: I83d42b63873569445d4c6339d7a69761e16ead14
Signed-off-by: Serhiy Pshyk <serhiyx.pshyk@intel.com>

ovs_events: Fix root Makefile.am

The location of OVS sources in Malefile.am is `src/*` folder now.

Change-Id: Iffe8a439faf531e74e0a752c3fb544369928cfb6
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

ovs_events: fix using of plugin_thread_create ()

- the prototype of plugin_thread_create () has been changed in
  latest master.

Change-Id: I492942442717c43cd6e6e73478248164b5083894
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

ovs_events: Fix PR code clean-up comments

- Fix OVS documentation
- Code clean-up

Change-Id: I84fb003aea19f73381192f31935c79b51eaba1c9
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

ovs_events: Fix OvS documentation URL address

Change-Id: I5bd4d7aabaf0ff66edd9c1cd75caf7f37448e00d
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

ovs_events: PR clean-up

Clean-up OVS events plugin based on PR comments.

Change-Id: Ibd18924dd2a6f936d0ea83ed4eeb3b34ff8416b5
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

ovs_events: Fix notification metadata garbage.

If some of interface data is not available, the garbage
information may be returned by ovs_events_get_iface_info() function.
Add clean-up interface information structure into the function.

Change-Id: Ia3d2bdfe31d0b3db81ad7ad773eca1df5d5f6f6a
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

ovs_events: Address PR comments

- Change configuration format to suggested one;
- Fix init/destroy API;
- Fix memory leaks;
- Code-clean-up.

Change-Id: I1ff94271b777c69f3d07a66f43dc10d034e71101
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

OVS events: Fix multiple interface config issue

If multiple interfaces are configured, only last one will
be monitored (notifications aren't sent for all others).

Change-Id: Ica918ef0557747d84677db739a64698d3756a675
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

OVS events: Address all PR comments

- Change OVS implementation to use suggested configuration:

   OvsDbAddress "127.0.0.1" "6640"
   OvsDbAddress "2001:DB8::c011:ec7d" "6640"
   OvsDbAddress "2001:DB8::c011:ec7d" "service-name"
   OvsDbAddress "unix:/path/to/socket"

- Update documentation;
- Change OVS utils to use getaddrinfo();
- Clean-up compilation warnings on FreeBSD system.
- Add IPv6 support;

Change-Id: I60ca700c15406c783b62ee52135266d67b60393a
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

OVS events: Fix configure script to detect YAJL tree API

If old YAJL version is installed on a system (ver < 2.0), the OVS plugin
compilation will fail as it requires tree API to be supported in YAJL
library. For this reason, it was decided to change 'configure' script
to detect YAJL tree API also.

Clean-up according updated collectd style:
  https://github.com/collectd/collectd/pull/1931
  https://github.com/collectd/collectd/issues/1951

Change-Id: I90c82cdc9780ee8c0c9b794986662a39a5ab0011
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

OVS events: Fix 'make distcheck'

Change-Id: I731b633b5f78ed63b643574a336c59717e408a78
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

ovs_events plugin: Filter through clang-format.

Disable clang-format for diagram in utils_ovs.c.

Change-Id: Idfb1510c996f5ebbdadc96663eb032537837502a
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

ovs_events: Fix plugin collectd config file

- Fix Ubuntu compilation warnings.

Change-Id: I7bb72ec0ca732b00c4169e0174d64407d99a2751
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

ovs_events: Add external ids as metadata

- Interface meta data are added to dispatched
  values & notification.
  interface metadata:
    - UUID (always);
    - iface-id (if exists)
    - vm-uuid (if exists)
- Fix read callback to poll actual data instead of
  reading cache;
- Code clean up;

Change-Id: I291cb190d31ae091c1d47ce0f5e9d439f6958d61
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

OVS link: rename "ovs_link" -> "ovs_events"

- Rename files

Change-Id: Ic662d5d673c1c66b2057e4b35fa3cf664e92825e
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

OVS link: rename plugin to "ovs_events"

Change-Id: Ic50891722074aec017b1329601a3bcbafb030ce0
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

OVS link plugin: Add connection terminate callback

Extend OVS utils to notify OVS plugin about OVS DB
connection lost. If the connection is lost, OVS link plugin
will dispatch notification and print error message. OVS plugin
treats status of all interfaces as UNKNOWN.

Change-Id: I22fe3cb0740e0f4779a5c4f6b92e78f1ad9777a3
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

OVS link plugin: Add read callback

- Implement read callback;
- Add SendNotification option;
- Update plugin documentation;
- Clean-up.

Change-Id: Ie645192498d234d47e1fe0272ec30e7c3d9c1774
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

OVS link: Implement OVS link plugin

This plugin consists of two parts:
 - OVS link
    The implementation of the plugin itself, which uses
    OVS utils API to be able to monitor a link status of
    OVS connected interfaces and dispatch the values
    through collectd notification mechanism whenever
    the link state change occurs.

 - OVS utils
    This module implements the OVS DB communication routine
    specified by RFC7047. It includes:
      - Connecting/disconnecting to/from OVS DB (via TCP/UNIX);
      - Mechanism to subscribe to OVS DB table events like
        init/insert/modify/delete table rows;
      - API to send custom request and receive result;
      - Recovery connection mechanism with OVS DB;
      - Handling of ECHO request to verify the liveness
        of a database connection;
      - Helpers functions.

Change-Id: Icac392bd1bd40f7dd156bfd2fc4ff08d9725a22f
Signed-off-by: Mytnyk, VolodymyrX <volodymyrx.mytnyk@intel.com>

Merge pull request #2003 from maryamtahhan/feat_ras

mcelog plugin

post rebase issues fixed

Change-Id: I42b4b392da942808d29b73a13cd5e0bbcef9b6b8
Signed-off-by: Krzysztof Matczak <krzysztofx.matczak@intel.com>

workaround for zero initializer false warning

Change-Id: I77a8ca1d5854ebda8533483cdd5ea08c3c07a059
Signed-off-by: Krzysztof Matczak <krzysztofx.matczak@intel.com>

PR comments addressed

Change-Id: I0ddfd6dcd911ab46fcbc032081a2980b1f1f549b
Signed-off-by: Krzysztof Matczak <krzysztofx.matczak@intel.com>

fixed rebase conflicts

Signed-off-by: Krzysztof Matczak <krzysztofx.matczak@intel.com>

dpdkstat plugin: jump to the right label

virt plugin: fix a few build warnings

src/virt.c:939:13: warning: initializing 'char *' with an expression of type 'const char [34]' discards qualifiers [-Wincompatible-pointer-types-discards-qualifiers]
      char *bd_xmlpath = "/domain/devices/disk/target[@dev]";
            ^            ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
src/virt.c:941:20: warning: assigning to 'char *' from 'const char [34]' discards qualifiers [-Wincompatible-pointer-types-discards-qualifiers]
        bd_xmlpath = "/domain/devices/disk/source[@dev]";
                   ^ ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

Fix rpm building

Fallout from c5cfdb0

Merge branch 'collectd-5.7'

Merge branch 'collectd-5.6' into collectd-5.7

src/daemon/common.c: Change swrite() to return errno if possible.

Merge pull request #2121 from octo/netapp

netapp plugin: Fix complation problems.

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2059'

Merge pull request #2085 from rubenk/non-recursive-make

Switch to non-recursive make

Switch to non-recursive make

Recursive make caused various dependency issues, mainly with linked
libraries or objects from other directories. Switch to a single Makefile
to solve this. An addded benefit is that this should speed up the build.
It also opens up the possibility to improve on our directory layout.

netapp plugin: Fix compilation problems.

Fixes: #2120

Auto-Merge pull request #2113 from rubenk/dpdk-double-close

Automatically merged due to "Automerge" label

Merge pull request #2114 from mfournier/dpdkstat-formatstring

dpdkstat: use portable format strings

dpdkstat: use portable format strings

Merge pull request #2112 from rubenk/battery-plugin-nul-terminate-buffer

Battery plugin: nul-terminate buffer

Merge branch 'collectd-5.7'

dpdkstat: don't close already closed fd on failure

CID #158525

battery plugin: null-terminate buffer

We call strstripnewline on it, which expects a null-terminated string.

CID #158524

Fix parallel build

Fixes #2110

Auto-Merge pull request #2053 from nuclearcat/master

Automatically merged due to "Automerge" label

Suggestions

More appropriate metric

Removing double reference

Adding support of drops value monitoring

Auto-Merge pull request #2111 from octo/cid/157643

Automatically merged due to "Automerge" label

src/utils_cmd_getthreshold.c: Fix formatting.

set target: Avoid casting negative int to size_t.

CID: 157643

Auto-Merge pull request #2099 from tokkee/sh/booleans

Automatically merged due to "Automerge" label

update README to mention write_prometheus & support lib

Auto-Merge pull request #2096 from rubenk/target-set-plug-leak

Automatically merged due to "Automerge" label

Auto-Merge pull request #2092 from rubenk/prometheus-plug-leak

Automatically merged due to "Automerge" label

Merge pull request #2100 from mojaves/pr-virt-disconnect-on-inst0

virt plugin: handle disconnect on inst#0

virt plugin: Use lv_disconnect on shutdown

Avoiding duplication of the code and let's use
the new lv_disconnect() helper in the lv_shutdown() callback.

Signed-off-by: Francesco Romani <fromani@redhat.com>

virt plugin: handle disconnect on inst#0

Only one virt reader instance should take care of connection
handling (connection/disconnection) to avoid races and plugin
data corruption, potentially crashing collectd.

This bug cannot be triggered with instances=1 (default settings).

Signed-off-by: Francesco Romani <fromani@redhat.com>

Merge pull request #2101 from mojaves/pr-virt-open-on-init

virt plugin: Open connection on init()

virt plugin: fail init with no libvirt connection

Even though we handle disconnection and reconnection
in the read() callback, we expect the libvirt connection
to be available most of the time, including the init()
stage.

Thus, let's fail init() if the connection is not available.

Signed-off-by: Francesco Romani <fromani@redhat.com>

virt plugin: Open connection on init()

If we use more than one reader instance, we can spot errors like
this in the system logs:

Dec 12 09:59:24 $HOST collectd[19338]: reading number of
domains: invalid connection pointer in virConnectNumOfDomains
Dec 12 09:59:24 benji.rokugan.lan collectd[19338]: read-function of
plugin `virt-2' failed. Will suspend it for 20.000 seconds.

This causes unnecessary delay in the sampling of libvirt.
The reason for this is just one instance (always #0) takes care
of establishing the libvirt connection.

But this could be done safely in the plugin init callback: according
to doc, this function is called at least once before all the read
instances.

Signed-off-by: Francesco Romani <fromani@redhat.com>